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AAL

Reference : http://www.cyceron.fr/freeware/readmeSPM2.txt J’ai tout sauvé dans SPM/AAL.zip

Charger SPM addpath(‘c:\spm2’) spm

1)on peux faire un addpath de là où se trouve la toolbox (pour l’instant, /home/devauche/matlab) puis lancer aal.

addpath('D:\Phil_Labo\Manuel_infos_outils\SPM2\CoordinatesFinder')

Ca va nous permettre de selectionner notre matrice de resultat et de labeler immediatement

2)on peux copier les ligne suivante : MNI=spm_get(1,'.img','select an labelised atlas'); Aller chercher l’atlas voulue (ROI_MNI_V4.img MNID=spm_vol(MNI); eval(['load ',strrep(MNI,'.img','_List.mat')]); eval(['load ',strrep(MNI,'.img','_Border.mat')]);

Ca va en fait chercher l’atlas voulue (ROI_MNI_V4.img). Puis il faut copier la ligne suivante en entrant à la main nos coordonnées entre crochet.

[Label,Dist] = gin_det_dlabels([-42;-42;42],MNID,ROI,BORDER_XYZ,BORDER_V);

Quand on tape la ligne suivante, ça donne les 3 régions, la premières étant celle ou on est, les deux autres étant les plus proches.

Label.Nom

ans =

SupraMarginal_R

ans =

Parietal_Inf_R

ans =

Angular_R

Sous PC ; faire un addpath du repertoire de ALL apres avoir lancé SPM2 : addpath('d:\Phil_Labo\Manuel_infos_outils\SPM2\CoordinatesFinder') Puis, apres avoir choisi l’option ‘maxima labelling’, aller chercher a la main l’atlas de labelisation.

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Page last modified on August 07, 2008, at 02:26 PM