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Distance

DISTANCE 1-Calcul de distance inter-sujets/inter-sessions La distance de COOK dit dans quelle mesure un sujet a un impact sur les stat fait sur un groupe de sujet (qu’est ce que ca change aux stat du groupe lorsqu’on le retire). La distance inter-sujet dit dans quelle mesure un sujet est proche du reste du groupe. En fait, la mean distance représente l’importance de chaque session vis-à-vis d’un barycentre (autrement dit : si j’enlève tel sujet, commet va varier mon barycentre, i.e l’analyse de groupe), barycentre qui est le centre des points qui représente les sujets dans l’espace fonctionnel ; cet espace fonctionnel est constituer d’un espace a 4D : les 3d de l’espace x,y,z d’une matrice de voxel, et la dimension temps (ou encore variation d’un contraste dans le temps). La matrice 3D mns représente une simplification (sur 3 axes) de la distribution des points-sujets dans cet espace. Plus les sujets sont repartis de façon isotrope (plus ils se ressemble, aussi, comme dans le contraste basique clic G – clic D), plus aucun axe ne sera privilégié (pas de sous-population particulière), + la variance expliqué par ce plot en analyse principale va s’effondrer (<50%).

TEST DE COOK Valeur du seuil adaptatif pour plus de 8 sujets: T = 4 / ( n - 2 ) avec n = nombre de sujets (0.078 pour 53 sujets)

On peut aussi faire des test inter-session. En ce cas, selectionner un sujet (le ‘noircir’) et faire un Add Session.

2-Affichage de plusieurs contrastes simultanément A partir de la fenêtre de départ, choisir en bas à droite ‘SPM result’
Load existing structure : No
Choose type of contraste image : SPM result
Choose loading procedure… : User specified SPM result
Choose SPM.mat : aller chercher les divers .mat (jusqu’à 12) dans nos répertoires de résultats
Choose loading procedure of contraste… :Same contrast (‘User specified’ si on veut comparer divers contrastes entre divers sujets)
Select contrast : slectionner le contraste a afficher
Choose number of anatomical : 1 (même anat pour tous) ou l’autre nombre pour choisir l’anat de chaque sujet
Choose loading procedure of anatomical image : User specified image (sinon, c’est une moyenne ou autre…)
Save parameters : Yes
Choose directory to save data : choisir un répertoire pour sauver ce travail
Type of probability / threshold / cluster extent: sélection du seuil du voxel

	Ca affiche alors les contraste. Une fenêtre interactive permet de changer le seuil des voxels affichés.

Attention : quand on crée un fichier de sujet à la main, attention qu’il n’y ai pas deux retour a la ligne consécutif. Attention aussi qu’entre deux sujet, il n’y ai pas un ‘espace’ caché sur une ligne de séparation qui doit etre vide !!!

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Page last modified on August 07, 2008, at 02:27 PM